محصولات

اصلاحات پروتئین پس از ترجمه، مانند فسفوریلاسیون تیروزین، برهمکنش های پروتئین-پروتئین (PPIs) را که برای پردازش سیگنال و فنوتیپ های سلولی حیاتی است، تنظیم می کند.ما یک سیستم دو هیبریدی مخمری را گسترش دادیم که از پروتئین کینازهای انسانی برای تجزیه و تحلیل PPIهای وابسته به فسفو تیروزین (pY) در یک رویکرد تجربی مستقیم و در مقیاس بزرگ استفاده می‌کرد.ما 292 PPI وابسته به pY جدید را شناسایی کردیم که ویژگی بالایی با توجه به کینازها و پروتئین‌های متقابل نشان دادند و بخش بزرگی را در آزمایش‌های رسوب ایمنی مشترک از سلول‌های پستانداران تأیید کردند.حدود یک ششم از برهمکنش ها توسط موتیف های اتصال توالی خطی شناخته شده واسطه می شوند در حالی که اکثر pY-PPI ها توسط سایر اپی توپ های خطی واسطه می شوند یا توسط حالت های تشخیص جایگزین کنترل می شوند.تجزیه و تحلیل شبکه نشان داد که رویدادهای شناسایی با واسطه pY به یک ماژول پروتئینی بسیار متصل اختصاص داده شده به مسیرهای سیگنالینگ و رشد سلولی مرتبط با سرطان مرتبط است.با استفاده از سنجش‌های اتصال، ترکیب پروتئین و بازخوانی‌های فنوتیپی برای مشخص کردن برهم‌کنش‌های وابسته به pY TSPAN2 (تتراسپانین 2) و GRB2 یا PIK3R3 (p55γ)، به طور مثال شواهدی ارائه می‌کنیم که دو PPI وابسته به pY فنوتیپ‌های سرطان سلولی را دیکته می‌کنند.