محصولات

بینش مکانیکی در مورد خانواده آلفا-مانوزیدازهای وابسته به Ca2+ در یک همزیستی روده انسان.

باکتری‌های کولون، که نمونه آن باکترویدیس تتایوتاومیکرون است، با استفاده از خانواده‌های بزرگ هیدرولازهای گلیکوزید (GHs) برای بهره‌برداری از پلی‌ساکاریدهای غذایی و گلیکان‌های میزبان به عنوان مواد مغذی، نقش کلیدی در حفظ سلامت انسان ایفا می‌کنند.چنین گسترش خانواده GH توسط 23 خانواده گلیکوزیدازهای GH92 که توسط ژنوم B. thetaiotaomicron کدگذاری شده اند، مثال زدنی است.در اینجا نشان می‌دهیم که این آلفا-مانوزیدازها هستند که از طریق یک مکانیسم جابجایی واحد برای استفاده از N-گلیکان میزبان عمل می‌کنند.ساختار سه بعدی دو مانوزیداز GH92 خانواده ای از پروتئین های دو دامنه ای را تعریف می کند که در آن مرکز کاتالیزوری در سطح مشترک دامنه قرار دارد و کمک اسید (گلوتامات) و باز (آسپارتات) به هیدرولیز در یک Ca(2+)- می کند. روش وابستهساختارهای سه‌بعدی GH92s در ترکیب با بازدارنده‌ها بینشی را در مورد ویژگی، مکانیسم و ​​برنامه‌ریزی ساختاری کاتالیزور فراهم می‌کنند.Ca(2+) نقش کاتالیزوری کلیدی در کمک به انحراف مانوزید از ساختار صندلی (4)C(1) پایه آن به سمت حالت گذار ایفا می کند.شیمی.Biol.6، 125-32، (2010)

کروماتوگرافی میل ترکیبی فرونتال گلیکوآسپاراژین های اووالبومین روی ستون کانکاناوالین A-سفاروز.یک مطالعه کمی از ویژگی اتصال لکتین.

فعل و انفعالات کانکاناوالین A (ConA) بی حرکت سفاروز 4B با 10 گلیکوآسپاراژین مشتق شده از اووالبومین به صورت کمی توسط کروماتوگرافی میل ترکیبی فرونتال مورد بررسی قرار گرفت.در این روش، یک محلول کربوهیدرات به طور مداوم به یک ستون ConA-Sepharose اعمال می شود و عقب ماندگی جبهه شستشو به عنوان پارامتری از قدرت برهمکنش اندازه گیری می شود.ثابت تفکیک (Kd) برای هر ساکارید با ConA را می توان تعیین کرد.تجزیه و تحلیل اتصال p-nitrophenyl-alpha، D-mannoside نشان داده است که خواص اتصال ConA اساساً پس از تثبیت در Sepharose 4B تغییر نمی کند.هر یک از گلیکوآسپاراژین های اووالبومین با تریتیوم با روش متیلاسیون کاهشی برای تجزیه و تحلیل برچسب گذاری شدند.مقایسه مقادیر Kd به‌دست‌آمده نشان داد که اتصال ConA به طور قابل‌توجهی با تفاوت‌های ساختاری بسیار جزئی زنجیره گلیکوزیل متفاوت است.نتایج نشان می دهد که ConA یک ساختار زنجیره گلیکوزیل خاص، Man alpha 1-6 (Man alpha 1-3)Man را تشخیص می دهد، که در آن حداقل یک گروه هیدروکسیل در موقعیت C-3 مانوز متصل به C-6 باید آزاد باشد.