محصولات

اخیراً گزارش داده‌ایم که نوکلئوتید پیرن ترجیحاً در مقابل یک سایت آباسیک، 3'-T یک دایمر تیمین، و اکثر بازهای آسیب‌دیده توسط DNA پلیمراز eta (pol eta) مخمر وارد می‌شود.از آنجایی که پیرن یک مولکول غیرقطبی بدون توانایی پیوند H است، راندمان بالای غیرعادی درج dPMP به توانایی بالای انباشته شدن پایه آن نسبت داده می‌شود و بر اهمیت انباشته شدن پایه در انتخاب نوکلئوتیدها توسط pol eta تاکید می‌کند.برای بررسی نقش پیوند H و هندسه جفت باز در انتخاب نوکلئوتیدها توسط pol eta، ما کارایی درج نوکلئوتیدهای اصلاح شده با پایه 2،6-دیامینوپورین، 2-آمینوپورین، 6-کلروپورین و اینوزین را تعیین کردیم. بسته به هندسه جفت پایه، تعداد متفاوتی از پیوندهای H با پایه الگو ایجاد کنید.به نظر می رسد جفت شدن پایه واتسون-کریک نقش مهمی در انتخاب آنالوگ های نوکلئوتیدی برای درج مقابل C و T ایفا می کند، همانطور که با کاهش راندمان درج نسبی با کاهش تعداد پیوندهای واتسون-کریک H و افزایش نشان می دهد. تعداد تعاملات اهداکننده- اهداکننده و پذیرنده-پذیرنده.گزینش پذیری درج نوکلئوتید در مقابل 5'-T بیشتر از 3'-T دایمر تیمین است، مطابق با کار قبلی که نشان می دهد 5'-T سفت تر از 3'-T نگه داشته می شود.علاوه بر این، به نظر می رسد درج A در مقابل هر دو T دایمر با جفت شدن پایه واتسون-کریک و نه با جفت شدن پایه هوگستین بر اساس بازده تقریباً یکسان درج A و 7-deaza-A انجام می شود، که دومی فاقد H- است. قابلیت اتصال در N7.راندمان نسبی برای درج نوکلئوتیدهایی که می‌توانند جفت‌های باز واتسون-کریک را تشکیل دهند، موازی با قطعه کلنو است، در حالی که قطعه کلنو با توجه به گزینش‌پذیری شکل بیشتر، به شدت در برابر عدم تطابق تمایز قائل می‌شود.این نتایج بر اهمیت پیوند H و هندسه جفت پایه واتسون-کریک در انتخاب نوکلئوتیدها توسط pol eta و قطعه Klen ow و نقش کمتر انتخاب شکل در درج توسط pol eta به دلیل بازتر و کمتر بودن آن تأکید می کند. سایت فعال محدود