محصولات

مطالعات مربوط به رسوب ایمنی کروماتین در سطح ژنوم (ChIP) بینش قابل توجهی را در مورد محلی سازی ژنومی پروتئین های مرتبط با کروماتین و تغییرات هیستون به ارمغان آورده است.با این حال، حجم زیادی از داده های تولید شده توسط این تجزیه و تحلیل ها، نیازمند رویکردهایی است که اعتبارسنجی و تجزیه و تحلیل سریع ارتباط بیولوژیکی را ممکن می سازد.علاوه بر این، هنوز اهداف پروتئینی و اصلاحی وجود دارد که تشخیص آنها با استفاده از روش های استاندارد تراشه دشوار است.برای رسیدگی به این مسائل، ما یک روش فوری رسوب ایمنی کروماتین را ایجاد کردیم که آن را ZipChip می نامیم.ZipChip به طور قابل توجهی زمان را کاهش می دهد و حساسیت را افزایش می دهد و امکان غربالگری سریع مکان های متعدد را فراهم می کند.در اینجا توضیح می‌دهیم که چگونه ZipChIP تشخیص تغییرات هیستون (H3K4 تک و تری متیلاسیون) و دو دمیلاز هیستون مخمر، Jhd2 و Rph1 را امکان‌پذیر می‌سازد، که قبلاً تشخیص آنها با استفاده از روش‌های استاندارد دشوار بود.علاوه بر این، ما تطبیق پذیری ZipChIP را با تجزیه و تحلیل غنی‌سازی هیستون دیست یلاز Sir2 در هتروکروماتین در مخمر و غنی‌سازی بازسازی‌کننده کروماتین، PICKLE، در یوکروماتین در Arabidopsis thaliana نشان می‌دهیم.